日本語AIでPubMedを検索
Bacillus thuringiensisと他の細菌由来の殺虫性タンパク質の構造に基づく命名法
A structure-based nomenclature for Bacillus thuringiensis and other bacteria-derived pesticidal proteins.
PMID: 32652083 DOI: 10.1016/j.jip.2020.107438.
抄録
1998年、Bacillus thuringiensis (Bt)由来の殺虫性タンパク質の命名法が、タンパク質の配列比較のみに基づいて作成されました。この命名法は広く採用され、タンパク質の命名と分類のための強固な枠組みを提供しました。これらのタンパク質が総合的な害虫管理スキームで成功を収めたことで、改良された、あるいはより多様な活性を持つ他のタンパク質の発見に向けた取り組みが活発になってきました。このような発見活動により、より広範囲の細菌からのタンパク質の特徴を明らかにし、多様なタンパク質のフォールドを持つタンパク質を発見することができました。これらの新しいタンパク質の多くは、Cryタンパク質としてまとめられていたため、これまでの命名法では多様なタンパク質を表現するには限界があることが明らかになりました。この命名法の改訂版では、1998年版の基本原則を踏襲しつつ、異なる構造グループを表現するための特殊なニーモニックを提供しています。一貫性を持たせるために、大部分のタンパク質の名称はそのままにするか、以前の名称を明確に参照する新しい名称にしました。以前に命名法に含まれていなかった他の農薬用タンパク質は、このバージョンに組み込まれています。
In 1998 a nomenclature for the growing list of pesticidal proteins from Bacillus thuringiensis (Bt) was derived based solely on protein sequence comparisons. This nomenclature was widely adopted and provided a robust framework for the naming and classification of the proteins. The success of these proteins in integrated pest management schemes prompted an increased effort to find others with improved or more diverse activities. These discovery activities led to the characterization of proteins from a wider range of bacteria and with a variety of different protein folds. Since most of these new proteins were grouped together as Cry proteins it became apparent that the existing nomenclature had limitations in representing the diverse range of proteins that had been identified. This revised nomenclature retains the basic principles of the 1998 version but provides specific mnemonics to represent different structural groups. For the purposes of consistency, the vast majority of the proteins have either retained their name or have a new name that clearly references the previous one. Other pesticidal proteins not previously included in the nomenclature have been incorporated into this version.
Copyright © 2020 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.