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レストレスレッグス症候群のトランスクリプトームワイド関連研究により、新たな感受性遺伝子が同定された
Transcriptome-wide association study for restless legs syndrome identifies new susceptibility genes.
PMID: 32651461 DOI: 10.1038/s42003-020-1105-z.
抄録
レストレスレッグス症候群（RLS）は，中欧や北米で5～15％の有病率を有する一般的な神経疾患である．ゲノムワイド関連研究（GWAS）により，いくつかの共通のリスク領域が同定されているが，原因遺伝子はまだ完全には解明されていない．我々は、最新の GWAS メタアナリシスと GTEx v7 および CMC 背外側前頭前野組織パネルの遺伝子発現ウェイトを用いて、RLS 症例 15,126 例と対照 95,725 例を対象としたトランスクリプトームワイド関連研究を実施した。そのうち、SKAP1、SLC36A1、CCDC57、FN3KRP、NCOA6/TRPC4APの6つは、前回のGWASでは関与していなかった。さらに、CMTR1、RP1-153P14.5、PRPF6、PPP3R1 を優先的に解析した結果、ドーパミン経路に直接関与している初めての RLS 関連遺伝子である PPP3R1 が発見されました。全体として、我々の知見は、遺伝子発現データと GWAS を統合して、機能的追跡調査のための原因遺伝子の優先順位を決定することの有用性を強調している。
Restless legs syndrome (RLS) is a common neurological condition, with a prevalence of 5-15% in Central Europe and North America. Although genome-wide association studies (GWAS) have identified some common risk regions for RLS, the causal genes have yet to be fully elucidated. We conducted a transcriptome-wide association study involving 15,126 RLS cases and 95,725 controls, from the most recent meta-analysis of GWAS, and gene expression weights of GTEx v7 and the CMC dorsolateral prefrontal cortex tissue panels. We identified 13 associations (in 8 independent loci) at the transcriptome-wide significant level, of which 6 were not implicated in the previous GWAS: SKAP1, SLC36A1, CCDC57, FN3KRP, NCOA6/TRPC4AP. A fine-mapping approach prioritized CMTR1, RP1-153P14.5, PRPF6, and PPP3R1 - to our knowledge, the latter of which is the first RLS-associated gene directly implicated in dopaminergic pathways. Overall, our findings highlight the power of integrating gene expression data with GWAS to prioritize putative causal genes for functional follow-up studies.