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Thoropa Cope, 1865 (Anura-Cycloramphidae) 属の細胞遺伝学的解析と反復配列に基づく進化推論
Cytogenetic analysis of the genus Thoropa Cope, 1865 (Anura-Cycloramphidae) with evolutionary inferences based on repetitive sequences.
PMID: 32648889 DOI: 10.1590/1678-4685-GMB-2019-0364.
抄録
細胞遺伝学は、広く用いられている形態学的・分子学的アプローチに情報を付加することで、分類学的問題を支援するための有用なツールとなり得る。これらの分類学的問題は、一旦、彼らは非常に多様で、高度に多型であり、多くの不明瞭な種を提示している、イヌ科では特に一般的である。Thoropa Cope, 1865属は、岩場の露頭で繁殖する6種の専門種で構成されており、大西洋森林とセラドの生態帯に分布している。系統学的研究では，T. miliaris属の中にも不明瞭な種が存在する可能性があることが指摘されている。このグループの進化と分類学的理解を助けるために、古典的な細胞遺伝学的手法を用いて、rDNA5S、rDNA18S、U2snDNAプローブを用いてこの属の可能性のある分子マーカーを見つけ出し、T. miliarisグループ内の染色体分布を解析した。従来の染色法やAg-NORなどの古典的な手法では核型がよく保存されているにもかかわらず、我々のC-bandingの結果は、T. miliarisの2つの集団間でのセントロメリックヘテロクロマチン濃度の違いを示していた。さらに、rDNA5SとU2snDNAについても個体群間、種間での違いが見られた。今回の研究は、T. miliaris属内の進化関係の理解を深めることに貢献するものであるが、より強固な細胞遺伝学的解析を行うためには、satDNAのような異なるプローブ配列を使用することが不可欠である。
Cytogenetics can be a useful tool to assist in taxonomic problems by adding information to the widely used morphological and molecular approaches. These taxonomic problems are especially common in anurans, once they are very diverse, highly polymorphic, and present many cryptic species. The genus Thoropa Cope, 1865 is composed of six specialist species that reproduce in rocky outcrops and are distributed throughout the Atlantic Forest and Cerrado ecotones. Phylogenetic studies point to possible cryptic species within the T. miliaris group. To assist in the evolutionary and taxonomic understanding of this group, classical cytogenetic techniques were used to find possible molecular markers for the genus through rDNA5S, rDNA18S, and U2snDNA probes and analyze their chromosome distribution in the group of T. miliaris. Despite the well conserved karyotype under conventional staining and classical techniques, such as Ag-NOR, our C-banding results showed differences in the centromeric heterochromatin concentration between two populations of T. miliaris. Furthermore, some differences among the populations and species were found for rDNA5S and U2snDNA. This study contributes to a better understanding of the evolutionary relationships within the genus; however, the use of different probe sequences, such as satDNA, is essential for a more robust cytogenetic analysis.