汎癌におけるYIF1Bの予後と免疫調節の役割：生存と治療効果評価の両方のターゲットとなる可能性がある

Prognostic and immune regulating roles of YIF1B in Pan-Cancer: a potential target for both survival and therapy response evaluation.

• Jun Liu
• Zheng Chen
• Pingsen Zhao
• Wenli Li

抄録

神経伝達物質であるセロトニンは、複雑なシグナル伝達経路を介して腫瘍増殖因子や免疫応答調節因子として浮上している。Yip1 Interacting Factor Homolog B (YIF1B)は、セロトニン受容体膜のトラフィッキングや神経障害におけるシグナル伝達に関与する膜タンパク質である。セロトニン誘導性腫瘍の増殖や免疫制御におけるYIF1Bの関与については、これまで調査されていませんでしたが、YIF1Bがセロトニン誘導性腫瘍の増殖や免疫制御に関与していることが明らかになりました。YIF1B mRNA発現解析のためのデータは、TCGA、GTEx、CCLE、ICGCのウェブサイトポータルから、臨床情報および突然変異情報を含めてダウンロードした。生存解析には、生存事象の累積発生率を計算するためのカプランマイヤー法と、群間の生存曲線を比較するためのログランク法を用いた。免疫細胞の浸潤レベルを計算し、有意性を評価するためにスピアマン相関検定を用いてYIF1B発現と相関させた。YIF1B発現と、腫瘍変異負担（TMB）、マイクロサテライト不安定性（MSI）、ミスマッチ修復（MMR）などの変異指標との間のさらなる相関分析も、スピアマン検定を用いて検討した。YIF1Bの発現はほとんどのがん種で上昇しており、この高発現は全生存率と死亡特異的生存率の低下を示していた。BRCAおよびLIHCでは、YIF1Bの高発現は無病期間の低さと相関し、悪性腫瘍の進行に関与していることを示した。いくつかのがん種において、YIF1Bの発現と免疫細胞浸潤との間には正の関係があり、また、YIF1Bはいくつかのがん種においてTMB、MSI、メチル化とも正の相関があり、YIF1Bの発現は治療効果の評価につながる可能性があることが示された。これらのバイオインフォマティクス解析により、YIF1Bは予後・治療評価に有用なバイオマーカーであることが確認されました。

The neurotransmitter serotonin has emerged as a tumor growth factor and immune response regulator through complex signaling pathways. Yip1 Interacting Factor Homolog B (YIF1B) is a membrane protein involved in serotonin receptor membrane trafficking and signal transmission in neuropathy. Participation of YIF1B in serotonin-induced tumor growth and immune regulation has not been previously investigated. Data for analysis of YIF1B mRNA expression were downloaded from the website portals TCGA, GTEx, CCLE and ICGC, including clinical and mutational information. Survival analysis included the Kaplan-Meier method for calculation of the cumulative incidence of the survival event and the log rank method for comparison of survival curves between groups. Infiltration levels of immune cells were calculated and correlated with YIF1B expression using the Spearman correlation test to evaluate significance. Further correlation analyses between YIF1B expression and mutation indicators such as tumor mutation burden (TMB), microsatellite instability (MSI), and mismatch repair (MMR) were also examined by the Spearman test. YIF1B expression was elevated in most cancer types and this high expression was indicative of poor overall survival and death specific survival. In BRCA and LIHC, high YIF1B expression correlated with a poor disease-free interval, indicating a role in malignancy progression. There was a positive relationship between YIF1B expression and immune cell infiltration in several cancer types, and YIF1B also positively correlated with TMB, MSI, and methylation in some cancer types, linking its expression to possible evaluation of therapy response. The bioinformatic analyses have, therefore, established YIF1B as a good biomarker for prognostic and therapeutic evaluation.

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