古代DNAデータセットにおける現代のDNA汚染

Present-Day DNA Contamination in Ancient DNA Datasets.

• Stéphane Peyrégne
• Kay Prüfer

抄録

現代のDNA汚染は、古代のDNA研究において誤った結論を導く可能性があります。汚染を推定するためには多くの方法が利用できますが、これらの方法は様々なシグナルを使用しており、様々なデータタイプに適しています。ここでは、現在利用可能な方法の概要を説明し、それぞれの長所と短所を強調し、汚染を推定するために使用されるシグナルに基づく分類を提案しています。この概要は、研究者がデータセットに最も適した方法を選択できるようにすることを目的としています。この分類に基づいて、手法のさらなる開発のための潜在的な道筋が議論されています。

Present-day contamination can lead to false conclusions in ancient DNA studies. A number of methods are available to estimate contamination, which use a variety of signals and are appropriate for different types of data. Here an overview of currently available methods highlighting their strengths and weaknesses is provided, and a classification based on the signals used to estimate contamination is proposed. This overview aims at enabling researchers to choose the most appropriate methods for their dataset. Based on this classification, potential avenues for the further development of methods are discussed.

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