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自己免疫性肝炎.エジプト患者における腸内細菌叢と代謝経路のシフト
Autoimmune Hepatitis: Shifts in Gut Microbiota and Metabolic Pathways among Egyptian Patients.
PMID: 32640728 DOI: 10.3390/microorganisms8071011.
抄録
自己免疫性肝炎（AIH）は、複雑な免疫原性を有する慢性炎症性疾患である。ディバイオシスは多くの自己免疫疾患と関連しているが、自己免疫性肝炎（AIH）におけるその詳細な役割は、特にエジプトではまだ厳密な評価が必要である。我々は、AIHエジプト人患者における腸内細菌叢のプロファイルの変化と、その結果として生じる代謝経路を健常者と比較して明らかにすることを目的とした。AIHを発症していない15人のAIH患者と10人の健常者から便を採取した。16S rRNA遺伝子のV3-V4超可変領域を増幅し、Illumina MiSeqプラットフォームを用いて配列決定した。AIH患者の細菌多様性は対照群と比較して有意に低かった。階層レベルでの解析では、Firmicutes、Bacteroides、Proteobacteriaの過剰発現が認められた。属レベルでは、AIHに関連した、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 。以上のことから、AIH患者の腸内細菌叢が自己免疫疾患における病原性の役割を果たしている可能性が示唆され、今後の大規模研究の必要性が示唆された。
Autoimmune hepatitis (AIH) is a chronic inflammatory disorder with complex immunopathogenesis. Dysbiosis has been linked to many autoimmune diseases, but its detailed role in autoimmune hepatitis (AIH) still needs rigorous evaluation, especially in Egypt. We aimed to identify the shift in the gut microbiota profile and resultant metabolic pathways in AIH Egyptian patients compared to healthy individuals. Stool samples were collected from 15 AIH-naive patients and from 10 healthy individuals. The V3-V4 hyper-variable regions in16S rRNA gene was amplified and sequenced using Illumina MiSeq platform. Significantly lower bacterial diversity in AIH patients was found compared to the controls. A phylum-level analysis showed the overrepresentation of Firmicutes, Bacteroides, and Proteobacteria. At the genus level, AIH-associated enrichment of , , , , , , and was reported in contrast to , and , which were significantly retracted in such patients. Overall, the predicted metabolic pathways associated with dysbiosis in AIH patients could orchestrate the potential pathogenic roles of gut microbiota in autoimmune disease, though not in a disease-specific manner, calling for future large-scale studies.