生殖系列シークエンシングにより、フィンランドの家族性生殖細胞腫瘍患者におけるまれなバリアントが同定された

Germline Sequencing Identifies Rare Variants in Finnish Subjects with Familial Germ Cell Tumors.

• Erin L Crowgey
• Tea Soini
• Nidhi Shah
• Satu-Liisa Pauniaho
• Pekka Lahdenne
• David B Wilson
• Markku Heikinheimo
• Todd E Druley

抄録

目的:

小児生殖細胞腫瘍はまれで、15歳未満の小児の悪性腫瘍の約3％を占め、新生児または青年期に発生し、年長の青年期に発生率が高いことが指摘されている。原始生殖細胞の増殖/分化の異常は、奇形腫、胚性がん、絨毛がん、および卵黄嚢腫瘍を含む様々な新生物をもたらしうる。

Purpose: Pediatric germ cell tumors are rare, representing about 3% of childhood malignancies in children less than 15 years of age, presenting in neonates or adolescents with a greater incidence noted in older adolescents. Aberrations in primordial germ cell proliferation/differentiation can lead to a variety of neoplasms, including teratomas, embryonal carcinoma, choriocarcinoma, and yolk sac tumors.

患者と方法:

さまざまな家族性生殖細胞腫瘍を有するフィンランドの3家族が同定され、Illuminaシークエンシングプラットフォームを用いて全ゲノムシークエンシングが実施された。3家族合計で22人のユニークな対象者がシークエンシングを受けた。第 1 家族の親父（女性）は悪性卵巣奇形腫、第 2 家族の親父（女性）はコーネリア・デ・ランゲ症候群の設定で卵黄嚢腫瘍を伴う仙嚢奇形腫、第 3 家族の親父（男性）は悪性精巣奇形腫に罹患していた。常染色体劣性またはde novo遺伝モデルを用いてまれな亜種が同定された。

Patients and Methods: Three Finnish families with varying familial germ cell tumors were identified, and whole-genome sequencing was performed using an Illumina sequencing platform. In total, 22 unique subjects across the three families were sequenced. Family 1 proband (female) was affected by malignant ovarian teratoma, Family 2 proband (female) was affected by sacrococcygeal teratoma with yolk sac tumor in the setting of Cornelia de Lange syndrome, and Family 3 proband (male) was affected by malignant testicular teratoma. Rare variants were identified using an autosomal recessive or de novo model of inheritance.

結果:

家族1の息子（女性）について、常染色体劣性遺伝またはde novo遺伝モデルにより、以下の遺伝子に関心のあるバリアントが同定された。および .第2子（女性）については、常染色体劣性遺伝モデルまたはde novalモデルを用いた解析により、以下の遺伝子の変異が確認されました： .家族3の子孫(男性)の解析により、以下の潜在的な遺伝子が同定されました。および .

Results: For family 1 proband (female), an autosomal recessive or de novo model of inheritance identified variants of interest in the following genes: , and . Family 2 proband (female) analysis identified gene variants of interest in the following genes: . Family 3 proband (male) analysis identified the following potential genes: , and .

結論:

深い血統と次世代シークエンシングを活用して、フィンランドの家族性生殖細胞腫瘍の既往歴を持つ3家族に富む稀な生殖細胞変異が同定された。今回発表されたデータは、体細胞突然変異の少ない複雑な癌を解析する際の生殖細胞突然変異の重要性を裏付けるものである。

Conclusion: Leveraging deep pedigrees and next-generation sequencing, rare germline variants were identified that were enriched in three families from Finland with a history of familial germ cell tumors. The data presented support the importance of germline mutations when analyzing complex cancers with a low somatic mutation landscape.

© 2020 Crowgey et al.