成長ホルモン受容体遺伝子の一塩基多型およびジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ1遺伝子の多型とヒツジの食肉生産量との関連について検討した

Single nucleotide polymorphisms in the growth hormone receptor gene and polymorphisms in the diacylglycerol acyltransferase 1 gene as related to meat production in sheep.

• Nada H Altwaty
• Lamiaa M Salem
• Karima F Mahrous

抄録

目的:

本研究では、Barki、Najdi、Harriを含む異なる品種のヒツジにおいて、成長ホルモン受容体（）遺伝子、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ1（）遺伝子を含む食肉生産に関連する遺伝子の多型を調査することを目的とした。

Aim: This study aimed to investigate the polymorphisms in genes related to meat production, including growth hormone receptor () and diacylglycerol acyltransferase 1 () genes, in different breeds of sheep, including Barki, Najdi, and Harri.

材料と方法:

健康なバルキ、ナジ、ハリの各羊の75種から無作為に血液サンプルを採取し、1種あたり25サンプルを採取した。

Materials and Methods: Blood samples were collected from 75 randomly selected healthy Barki, Najdi, and Harri breeds of sheep, with 25 samples per breed. and genes were identified using a single nucleotide polymorphism assay followed by digestion with the restriction enzyme .

結果:

遺伝子の塩基配列を解析した結果、エクソン10のnt69にヌクレオチド置換が認められた（c.69 G > A）；この変異は遷移変異と考えられる。この遺伝子に検出されたSNPの配列をGenBankデータベースに登録し、アクセッション番号MG906773〜MG906781で公開した。エクソン10での置換(c.69 G > A)はアミノ酸の変化(p.リジン > アルギニン)をもたらす。ｃ.69でのＡ対立遺伝子頻度は0.61、0.59、および0.54であり、一方、Ｇ対立遺伝子頻度は、バルキ種、ナジュディ種、およびハリ種でそれぞれ0.39、0.41、および0.46であった。nt 69遺伝子座の遺伝子型AGは、NajdiとHarriで最も頻度が高かった。AGの頻度は0.62、0.61、0.64であり、一方、AAの頻度はBarki、Najdi、Harri羊でそれぞれ0.30、0.28、0.22であった。制限酵素で消化した結果、この遺伝子座はCCとCTの2つの遺伝子型を持っていた。最も頻度が高いのは対立遺伝子Cで、0.88回であり、バルキ種で検出された。同じ対立遺伝子の頻度が最も低かったのはHarriで、0.75であった。

Results: The analysis of the gene sequence showed nucleotide substitutions at nt 69 in exon 10 (c.69 G > A); this mutation is considered a transition mutation. The sequences of detected SNPs in the gene in the different sheep breeds were submitted to the GenBank database with accession numbers MG906773 to MG906781. The substitutions at exon 10 (c.69 G > A) results in an alteration to the amino acid (p. Lysine > Arginine). At c.69, the A allele frequency was 0.61, 0.59, and 0.54, while the G allele frequency was 0.39, 0.41, and 0.46, for Barki, Najdi, and Harri breeds, respectively. The genotype AG at nt 69 locus had the highest frequency in the Najdi and Harri sheep. The frequency of AG was 0.62, 0.61, and 0.64, while the frequency of AA was 0.30, 0.28, and 0.22, for Barki, Najdi, and Harri sheep, respectively. After digestion with the restriction enzyme , the locus had two genotypes, CC and CT. The highest frequency, 0.88, was found for allele C, which was detected in Barki breed. The lowest frequency, 0.75, for the same allele was found for Harri.

結論:

検出されたCT遺伝子型は、Barki羊種の中等度の筋肉内脂肪含量と筋肉の霜降りを説明する可能性がある。

Conclusions: The detected CT genotype may explain the moderate intramuscular fat content and muscle marbling in the Barki sheep breed.

Copyright: © Altwaty, et al.