インド・パンジャブ州のジャット・シク族集団におけるX-STRマーカーの遺伝的多様性と他の世界の39の集団との比較

Genetic diversity of X-STR markers in Jat Sikh population of Punjab, India and its comparison with other 39 global populations.

• Sonia Kakkar
• Pankaj Shrivastava
• Vivek Sahajpal
• Arun Sharma
• Nisha Devi
• S P Mandal
• R K Kumawat

抄録

ジャット・シク族集団はインド北西部のパンジャブ州最大の内地集団であり、X-STR遺伝子マーカーに基づく遺伝的多型の探索はまだ行われていない。世界で2番目に人口の多いインドでは、これまでにX-STRマーカーに基づく集団研究は2件しか報告されていない。パンジャブ州のジャット・シク族集団における12のX-STR遺伝子マーカーの遺伝的多様性を探り、X-STR多型データベースを拡充することを目的とした。本研究では、パンジャブ州に居住する合計200人のジャット・シク人（男性100人、女性100人）を対象に、Investigator Argus X-12 QS Kitを用いて12個のX-STRマーカーについて調査した。識別力（PD）の最高値は、女性では0.965（DXS10135）、男性では0.929（DXS10135とDXS10148）であることが観察された。DXS10135は、男女ともに研究した遺伝子座の中で最も多型であり、識別力（PD）と多型情報量（PIC）の値が最も高いことがわかった。全体的に、Argus 12 X-STRキットで調査したマーカーは高い多相性情報を提供し、行方不明者の特定、近親相姦、移民紛争、親族分析、家系研究などの問題を解決するための重要なツールとなる可能性があることがわかりました。この研究で得られたデータセットは、現在のX-STRのデータベースに追加されます。

The Jat Sikh population is the largest endogamous group of Punjab, a state in north-west India, and has not yet been explored for genetic polymorphism based on X-STR genetic markers. In India, which is the second most populous country in the world, only two population studies based on X-STR markers have been reported so far. To explore the genetic diversity of 12 X chromosomal STR genetic markers in the Jat Sikh population of Punjab and expand the X-STR polymorphism database. In this study, a total of 200 Jat Sikh individuals (100 males and 100 females) residing in Punjab were investigated for 12 X-STR markers using the Investigator Argus X-12 QS Kit. The highest power of discrimination (PD) in females (PD) and males (PD) was observed to be 0.965 (DXS10135) and 0.929 (DXS10135 and DXS10148), respectively. DXS10135 was found to be the most polymorphic and discriminating locus among all the studied loci in both males and females with highest values of power of discrimination (PD) and polymorphic information content (PIC) as well. Overall, the studied markers of the Argus 12 X-STR kit provide high polymorphic information which may prove to be an important tool in resolving issues such as missing person identification, incest, immigration disputes, kinship analysis and genealogical studies. The dataset obtained from this study will add to the present database of X-STRs.