青海チベット高原におけるB型肝炎ウイルスの完全ゲノム解析：地理的分布、遺伝的多様性、HBsAg抗体と抗HBs抗体の共存

Complete genome analysis of hepatitis B virus in Qinghai-Tibet plateau: the geographical distribution, genetic diversity, and co-existence of HBsAg and anti-HBs antibodies.

• He Liu
• Liping Shen
• Shuang Zhang
• Feng Wang
• Guomin Zhang
• Zundong Yin
• Feng Qiu
• Xiaofeng Liang
• Fuzhen Wang
• Shengli Bi

抄録

背景:

青海チベット高原におけるB型肝炎ウイルス（HBV）の遺伝的多様性と起源については、あまり研究されていなかった。HBsAgと抗HBsの共存はパズルのように記述されており、これまで土着集団や組換えHBV配列では報告されたことがなかった。本研究は、中国南西部におけるHBVの地理的分布、遺伝的変動、血清疫学を報告することを目的とした。

BACKGROUND: The genetic variation and origin of Hepatitis B Virus (HBV) in Qinghai-Tibet Plateau were poorly studied. The coexistence of HBsAg and anti-HBs has been described as a puzzle and has never been reported in the indigenous population or in recombinant HBV sequences. This study aimed to report geographical distribution, genetic variability and seroepidemiology of HBV in southwest China.

方法:

2014 年から 2017 年の間に、1263 例の HBsAg 陽性血清が同定され、183 例の完全ゲノム配列が得られた。血清サンプルは、多段階ランダムサンプリング法により、コミュニティベースの集団から収集した。ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）を用いてHBV完全ゲノム配列を増幅した。その後、組換え、遺伝的変異、および血清学的解析を行った。

METHODS: During 2014-2017, 1263 HBsAg positive serum were identified and 183 complete genome sequences were obtained. Serum samples were collected from community-based populations by a multistage random sampling method. Polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the HBV complete genome sequences. Then recombination, genetic variability, and serological analysis were performed.

結果:

(1) HBsAg陽性血清サンプル1263例のうち、チベットと青海省ではセロマーカーの分布に有意な差があった。(2)全ゲノム配列183例のうち、HBV/CD1が130例（71.0％）、HBV/CD2が49例（26.8％）、HBV/C2分離株が4例（2.2％）であった。主な血清型はayw2（96.1％）であった。(3) CD1 と CD2 の配列では、いくつかのヌクレオチド変異が劇的に異なっていた。CD組換え体では、ヌクレオチド変異T1762/A1764（27.93％）、A2189C（12.85％）、G1613A（8.94％）、T1753C（8.38％）、T53C（4.47％）、T3098C（1.68％）、PreS欠失（2.23％）などの臨床予後に関連した遺伝的変異が検出された。(4)中国の内地からインドの北東部境界まで、CD1とCD2の間に異なる地理的分布が確認された。(5) 27例（2.14％）のHBsAg/HBsAb共存血清が同定された。Sタンパク質のアミノ酸変異とPreS欠失はHBsAg/HBsAb共存群と対照群で有意差があった。

RESULTS: (1) Of the 1263 HBsAg positive serum samples, there were significant differences between the distribution of seromarkers in Tibet and Qinghai. (2) Of 183 complete genome sequences, there were 130 HBV/CD1 (71.0%), 49 HBV/CD2 (26.8%) and four HBV/C2 isolates (2.2%). Serotype ayw2 (96.1%) was the main serological subtype. (3) Several nucleotide mutations were dramatically different in CD1 and CD2 sequences. Clinical prognosis-related genetic variations such as nucleotide mutation T1762/A1764 (27.93%), A2189C (12.85%), G1613A (8.94%), T1753C (8.38%), T53C (4.47%) T3098C (1.68%) and PreS deletion (2.23%) were detected in CD recombinants. (4) From the inner land of China to the northeast boundary of India, different geographical distributions between CD1 and CD2 were identified. (5) Twenty-seven (2.14%) HBsAg/HBsAb coexistence serum samples were identified. S protein amino acid mutation and PreS deletion were with significant differences between HBsAg/HBsAb coexistence group and control group.

結論:

HBV/CDは中国と南アジアの混合起源の可能性がある。遺伝的変異に基づいて、組み換えCDの臨床予後は、中国ではジェノタイプC株よりも温和であるように思われる。HBsAg/HBsAbの共存は、PreS欠失とSタンパク質のaa変異の両方の結果である。HBV/CD分離株では、いくつかのユニークな変異が頻繁に検出され、臨床予後に影響を与える可能性がある。

CONCLUSIONS: HBV/CD may have a mixed China and South Asia origin. Based on genetic variations, the clinical prognosis of CD recombinant seems more temperate than genotype C strains in China. The HBsAg/HBsAb coexistence is a result of both PreS deletion and aa variation in S protein. Several unique mutations were frequently detected in HBV/CD isolates, which could potentially influence the clinical prognosis.