フレンチブルドッグの新しいブラウンコートカラー（ココア）のナンセンス変異体からの結果

Novel Brown Coat Color (Cocoa) in French Bulldogs Results from a Nonsense Variant in .

• Sarah Kiener
• Alexandra Kehl
• Robert Loechel
• Ines Langbein-Detsch
• Elisabeth Müller
• Danika Bannasch
• Vidhya Jagannathan
• Tosso Leeb

抄録

多くの哺乳類種における茶色またはチョコレート色の毛色は、頻繁にB遺伝子座または遺伝子の変異に起因する。犬では、茶色の毛色を持つ犬の大多数を説明する5つの異なる機能喪失対立遺伝子が記述されている。最近、ブリーダーや遺伝子検査機関は、既知の変異対立遺伝子のいずれも持たない茶色のフレンチブルドッグを同定した。我々は茶色のフレンチブルドッグのゲノムを配列決定し、そのデータを655の他のイヌのゲノムと比較した。プライベートバリアントの検索により、c.2420G>Aまたはp.（Trp807*）のナンセンスバリアントが明らかになった。この褐色犬は、このバリアントにおける突然変異対立遺伝子のホモ接合体であった。この遺伝子は、メラノソームを含むライソソーム関連小器官の正しい生合成に必要なタンパク質をコードしている。ヒト遺伝子の変異体は、軽度の眼球皮白化症と出血時間の延長を伴うハーマンスキー・プドラック症候群3の原因となる。マウス遺伝子の変異体は、マウス変異体では褐色の毛色を引き起こす。373頭のフレンチブルドッグのコホートをジェノタイプ化したところ，ホモ接合変異遺伝子型と褐色被毛色との間に強い関連性が認められた．遺伝子型とフェノタイプの関連性と他種の機能に関する包括的な知見から、:c.2420G>Aがフレンチブルドッグで観察された褐色の毛色の原因となる変異体であることが強く示唆された。関連性のある褐色毛色と関連性のある褐色毛色を明確に区別するために、マウスの命名法に沿って、この犬の表現型を「ココア」、変異対立遺伝子を「ココア」と命名することを提案する。

Brown or chocolate coat color in many mammalian species is frequently due to variants at the B locus or gene. In dogs, five different loss-of-function alleles have been described, which explain the vast majority of dogs with brown coat color. Recently, breeders and genetic testing laboratories identified brown French Bulldogs that did not carry any of the known mutant alleles. We sequenced the genome of a brown French Bulldog and compared the data to 655 other canine genomes. A search for private variants revealed a nonsense variant in , c.2420G>A or p.(Trp807*). The brown dog was homozygous for the mutant allele at this variant. The gene encodes a protein required for the correct biogenesis of lysosome-related organelles, including melanosomes. Variants in the human gene cause Hermansky-Pudlak syndrome 3, which involves a mild form of oculocutaneous albinism and prolonged bleeding time. A variant in the murine gene causes brown coat color in the mouse mutant. We genotyped a cohort of 373 French Bulldogs and found a strong association of the homozygous mutant genotype with the brown coat color. The genotype-phenotype association and the comprehensive knowledge on function from other species strongly suggests that :c.2420G>A is the causative variant for the observed brown coat color in French Bulldogs. In order to clearly distinguish -related from the -related brown coat color, and in line with the murine nomenclature, we propose to designate this dog phenotype as "cocoa", and the mutant allele as .