ハゲタカの保全を最適化するための腸内細菌の多様性と飼育下飼育の統合

Integrating Gut Bacterial Diversity and Captive Husbandry to Optimize Vulture Conservation.

• Anne A M J Becker
• Stephen W R Harrison
• Gerard Whitehouse-Tedd
• Jane A Budd
• Katherine M Whitehouse-Tedd

抄録

絶滅危惧種の回復計画には、多くの場合、飼育下繁殖と再導入が含まれているが、成功することは稀である。効果的な回復には、再導入候補種の適応形質における飼育下での変化を評価することが重要である。腸内細菌叢はそのような形質の一つであり、枝肉微生物叢にさらされたスカベンジャーにとっては特に重要である。我々は、16S RNA 遺伝子アンプリコンシークエンシングを用いて、2 種の旧世界のハゲワシの腸内細菌叢における飼育に関連した違いを調査した。ハゲタカにウズラを食べさせるとアクチノバクテリアが増加したが、ラットやニワトリを食べさせないとアクチノバクテリアが増加した。逆に、細菌の多様性はハゲタカの種間で有意に異なっていたが、食事の調製（除菌）は何の影響もなかった、おそらく進化した摂食生態を反映していた。除菌された食餌の影響が相対的に欠如していることは心強いが、餌の種類に関連した細菌の豊富さの変化が発生し、種の回復計画で考慮する必要がある宿主-微生物の状態に食餌の影響を表しています。したがって、絶滅危惧種の管理にマイクロバイオーム研究を取り入れることは、保全の実践を洗練させる機会となる。

Endangered species recovery plans often include captive breeding and reintroduction, but success remains rare. Critical for effective recovery is an assessment of captivity-induced changes in adaptive traits of reintroduction candidates. The gut microbiota is one such trait and is particularly important for scavengers exposed to carcass microbiomes. We investigated husbandry-associated differences in the gut microbiota of two Old World vulture species using 16S RNA gene amplicon sequencing. Increased abundance of Actinobacteria occurred when vultures were fed quail but not rat or chicken. Conversely, diet preparation (sanitization) had no effect, although bacterial diversity differed significantly between vulture species, likely reflective of evolved feeding ecologies. Whilst the relative lack of influence of a sanitized diet is encouraging, changes in bacterial abundance associated with the type of prey occurred, representing a dietary influence on host-microbiome condition warranting consideration in species recovery plans. Incorporation of microbiome research in endangered species management, therefore, provides an opportunity to refine conservation practice.

Copyright © 2020 Becker, Harrison, Whitehouse-Tedd, Budd and Whitehouse-Tedd.