河川流出に関連する細菌群集と環境要因とサンゴ礁保全への影響

Bacterial community and environmental factors associated to rivers runoff and their possible impacts on coral reef conservation.

• Gustavo Vasconcelos Bastos Paulino
• Ciro Ramon Félix
• Cinta Gomez Silvan
• Gary L Andersen
• Melissa Fontes Landell

抄録

河川は、人為的ストレス要因の結果として、サンゴ礁に重要な成分をもたらす可能性があります。河川やサンゴ礁の生物学的・化学的モニタリングには、分子技術がますます利用されるようになってきています。ここでは、ブラジル北東部の環境保護地域にある2つの河川とそれに関連するサンゴ礁で採取した表流水サンプルをPhyloChips™を用いて処理しました。その結果、同定されたOperational Taxonomic Units (OTU)の大部分が淡水から海水への移行に耐えられることが判明し、そのうちのいくつかはヒトの病因に関与する属に属することがわかった。BBC:A比と機能予測から、両調査河川は糞便汚染や外来生物の影響を受けており、細菌群集はこれらの環境下でより均質なものであったことが示唆された。本研究では、岩礁に対して採用されている保護対策を周辺環境にも広く適用し、日常的な水質モニタリングには培養性大腸菌群以外の細菌群を含めるべきであることを示唆している。

Rivers potentially conduct important components as result of anthropogenic stressors for coral reefs. Molecular techniques are increasingly being used for monitoring biological and chemical monitoring of rivers and reefs. Here, we use PhyloChips™ to process surface water samples collected along two rivers and associated reefs in an environmental protection area in northeastern Brazil. Our results indicate that a significant part of Operational Taxonomic Units (OTUs) identified were able to survive the transition from freshwater to seawater, several of them belonging to genera implicated in human pathogenesis. The BBC:A ratio and functional prediction suggests that both study rivers are subject to fecal contamination and xenobiotics input and that the bacterial communities were more homogeneous in these environments. We suggest that protection actions adopted for reefs should be broadly extended to the surrounding environment, and that other bacterial group (besides cultivable coliforms) should be included in routine water quality monitoring.

Copyright © 2020 Elsevier Ltd. All rights reserved.