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Front Cell Dev Biol.2020;8:357. doi: 10.3389/fcell.2020.00357.Epub 2020-05-19.

次世代シークエンシング時代の慢性リンパ性白血病(CLL)における体細胞超変異状態の評価

Evaluation of Somatic Hypermutation Status in Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) in the Era of Next Generation Sequencing.

  • Sanjeev Kumar Gupta
  • David S Viswanatha
  • Keyur P Patel
PMID: 32509784 PMCID: PMC7248390. DOI: 10.3389/fcell.2020.00357.

抄録

慢性リンパ性白血病(CLL)は、成熟型B細胞性白血病の非常に一般的なタイプであり、体細胞超変異(SHM)状態は重要な予後指標となる。変異していない免疫グロブリン重鎖可変型(IGHV)状態に関連した有害な予後のために、SHM検査はCLLの標準治療として実施されています。従来、SHM検査は、CLL細胞内のクローン性免疫グロブリン重鎖遺伝子再配列のPCR増幅後に、手間のかかる、主にアナログのサンガーシークエンシング法を用いて実施されてきた。それに比べて、最近では次世代シークエンシング(NGS)が利用できるようになったことで、より汎用性の高い検出が可能になり、腫瘍性B細胞集団におけるクローン性免疫グロブリン遺伝子再配列の直接同定が可能になりました。ベースライン(診断)と治療後の両方の環境で特異的なクローン性IGHVシグネチャを同定する能力により、SHM状態の決定、最小残存病変(MRD)モニタリング、クローンの不均一性およびB細胞受容体IGのステレオタイプの決定など、NGSのユニークな臨床応用が可能となる。困難な症例の例を含め、NGSを用いたSHM判定のための現在の実践と推奨事項のレビューを提供します。

Somatic hypermutation (SHM) status provides an important prognostic indicator for chronic lymphocytic leukemia (CLL), a very common type of mature B-cell leukemia. Owing to the adverse prognosis associated with an unmutated immunoglobulin heavy chain variable (IGHV) status, SHM testing is performed as a standard of care in CLL. Conventionally, SHM testing has been performed using labor intensive and primarily analog Sanger sequencing method following PCR amplification of the clonal immunoglobulin heavy chain gene rearrangements in CLL cells. In comparison, recent availability of next generation sequencing (NGS) allows more versatile detection and direct identification of clonal immunoglobulin gene rearrangements in neoplastic B-cell populations. The ability to identify specific clonal IGHV signature(s) in both baseline (diagnostic) and post-treatment settings enables unique clinical applications of NGS such as determination of SHM status, minimal residual disease (MRD) monitoring, clonal heterogeneity and B cell receptor IG stereotypy. We provide a review of current practices and recommendations for SHM determination using NGS including examples of difficult cases.

Copyright © 2020 Gupta, Viswanatha and Patel.