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韓国原産タイムの形態学的、化学的、遺伝的特徴 Bak-ri-hyang ( Celak.)
Morphological, Chemical, and Genetic Characteristics of Korean Native Thyme Bak-Ri-Hyang ( Celak.).
PMID: 32481500 PMCID: PMC7344789. DOI: 10.3390/antibiotics9060289.
抄録
Bak-ri-hyang ( Celak.)は韓国の重要な薬用・芳香植物である。そこで、本研究では、韓国原産の3つのタイムの遺伝的多様性と精油組成を、市販の6つのタイム品種（）と比較して決定し、バクイリヒャンを他のタイム品種と区別することを目的とした。9個体から得られた精油の組成をガスクロマトグラフィー-質量分析法（GC-MS）で分析した。ランダム増幅多型DNA（RAPD）分析は、16種類のプライマーを用いて行った。GC-MS分析の結果、ウォルチュル、クリーピング、ゴールデン、オレンジの各品種はゲラニオールケモタイプに属することが明らかになった。一方、オデ、レモン、シルバーはチモール化学型に属することがわかった。また，リナロールは，カーペット，ジリの各品種に最も多く含まれていた。RAPD分析の結果、すべてのタイムの品種が特徴的なRAPDパターンを示しており、その同定が可能であった。16個のプライマーを用いて合計133個のバンドが得られ、124個のバンドは多型であり、93.2％の多型に対応していた。RAPDマーカーのクラスタ分析により、9つのタイムの栽培品種からの明確な分離の存在が確立された。RAPDマーカーの最高の非類似度係数と類似度係数はそれぞれ0.58と0.98であった。RAPDパターンによると、9つのタイム栽培品種は大きく2つのクラスターに分けることができた。韓国の3品種のうち、ウォルチョルとオデの2品種は同一クラスターに入っていたが、精油組成では同一のクラスター化は見られなかった。本研究で得られた知見は、RAPD分析が他種からのマーカー支援同定に有用なツールとなり得ることを示唆している。
Bak-ri-hyang ( Celak.) is an important medicinal and aromatic plant in Korea. population and is always mixed with other thyme cultivars during cultivation and marketing. Hence, this study aimed to determine the genetic variability and the essential oil composition of three Korean native thyme, cultivars collected from the Wolchul, Jiri, and Odae mountains, in comparison with six commercial thyme cultivars (), to distinguish Bak-ri-hyang from other thyme cultivars. The composition of essential oils obtained from nine individuals was analyzed by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). The random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was accomplished using 16 different primers. The GC-MS analysis revealed that Wolchul, creeping, golden, and orange cultivars belong to the geraniol chemotype. Whereas the Odae, lemon, and silver cultivars belong to the thymol chemotype. Further, linalool was the most abundant component in carpet and Jiri cultivars. The RAPD analysis demonstrated that all thyme cultivars showed characteristic RAPD patterns that allowed their identification. In total, 133 bands were obtained using 16 primers, and 124 bands were polymorphic, corresponding to 93.2% polymorphism. Cluster analysis of RAPD markers established the presence of clear separation from nine thyme cultivars. The highest dissimilarity and similarity coefficient of the RAPD markers were 0.58 and 0.98, respectively. According to the RAPD patterns, the nine thyme cultivars could be divided into two major clusters. Among three Korean cultivars, the Wolchul and Odae cultivars were placed into the same cluster, but they did not show identical clustering with their essential oil compositions. The findings of the present study suggest that RAPD analysis can be a useful tool for marker-assisted identification of from other species.