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SARS-CoV-2 RNAレプリケーション機構の構造的展望。RNA合成、プルーフリーディング、最終キャッピング
A Structural View of SARS-CoV-2 RNA Replication Machinery: RNA Synthesis, Proofreading and Final Capping.
PMID: 32443810 PMCID: PMC7291026. DOI: 10.3390/cells9051267.
抄録
現在のコロナウイルス病2019（COVID-19）パンデミックは、新規コロナウイルスSARS-CoV-2によるものである。科学界は、研究とイノベーションを加速させることで強力な対応をマウントし、標的治療介入の開発のための疾患の分子決定要因を理解するための基礎を迅速に設定しました。感染細胞内でのウイルスゲノムの複製は、SARS-CoV-2のライフサイクルの重要な段階である。これは、RNAの重合、プルーフリーディング、最終的なキャッピングを行うために、いくつかのウイルスおよび宿主タンパク質の作用が関与する複雑なプロセスである。本レビューでは、SARS-CoV-2の複製機構の主要なアクターの構造・機能データを更新し、主にホモロジーモデルを用いて得られた現在の構造データのギャップを埋める。さらに、類似ウイルスからのデータをもとに、SARS-CoV-2のRNAポリメラーゼ機構のタンパク質アクター間の相互作用パターンを再構成するための文献データを収集している。ここでは、Nsp8やNsp10などの共役因子が、アロステリック活性化因子としてだけでなく、RNA複製の効率を高めるために機械全体をつなぎ合わせる分子コネクターとして重要な役割を果たしていることを示している。
The current coronavirus disease-2019 (COVID-19) pandemic is due to the novel coronavirus SARS-CoV-2. The scientific community has mounted a strong response by accelerating research and innovation, and has quickly set the foundation for understanding the molecular determinants of the disease for the development of targeted therapeutic interventions. The replication of the viral genome within the infected cells is a key stage of the SARS-CoV-2 life cycle. It is a complex process involving the action of several viral and host proteins in order to perform RNA polymerization, proofreading and final capping. This review provides an update of the structural and functional data on the key actors of the replicatory machinery of SARS-CoV-2, to fill the gaps in the currently available structural data, which is mainly obtained through homology modeling. Moreover, learning from similar viruses, we collect data from the literature to reconstruct the pattern of interactions among the protein actors of the SARS-CoV-2 RNA polymerase machinery. Here, an important role is played by co-factors such as Nsp8 and Nsp10, not only as allosteric activators but also as molecular connectors that hold the entire machinery together to enhance the efficiency of RNA replication.