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メチオニンアデノシルトランスフェラーゼ I/III 欠損症の新生児スクリーニングとバリアント解析
[Newborn screening and variant analysis for methionine adenosyltransferase I/III deficiency].
PMID: 32335878 DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2020.05.008.
抄録
目的:
福建省泉州地域におけるメチオニンアデノシルトランスフェラーゼI/III（MAT I/III）欠損症の新生児スクリーニングについてまとめる。
OBJECTIVE: To summarize newborn screening for methionine adenosyltransferase I/III (MAT I/III) deficiency in Quanzhou region of Fujian Province.
方法:
合計 364 545 人の新生児を対象に、タンデム質量分析法を用いて遺伝性代謝疾患のスクリーニングを行った。MAT I/III 欠損症の新生児における潜在的な変異体を検出するために、ハイスループット次世代シークエンシングとサンガーシークエンシングを組み合わせて使用した。MutationTaster と HSF ソフトウェアを使用して、疑われる変異体の病原性を予測しました。
METHODS: A total of 364 545 neonates were screened for inherited metabolic diseases by tandem mass spectrometry. High-throughput next generation sequencing combined with Sanger sequencing was used to detect potential variants in newborns with MAT I/III deficiency. Pathogenicity of suspected variants was predicted by using MutationTaster and HSF software.
結果:
新生児スクリーニングにより 3 人の新生児が MAT I/III 欠乏症であることが確認され，その発生率は 121 515 人に 1 人であった．アミノ酸とアシルカルニチンの分析から、3人の患者の血清メチオニンが様々な範囲で増加していることが示唆された。すべての患者は追跡調査中に正常な成長と発育を示し、2つのミスセンスバリアント[c.776C>T (p.Ala259Val)とc.791G>A (p.Arg264His)を含むMAT1A遺伝子バリアント[c.360C>T (p.Cys120Cys)]と同義バリアント[c.360C>T (p.Cys120Cys)]を保有していることが判明しました。このうち、c.776C>T (p.Ala259Val)とc.791G>A (p.Arg264His)は病原性が知られていたが、c.360C>T (p.Cys120Cys)は新規変異体であった。バイオインフォマティクス解析の結果、この変異体はRNAスプライシングを変化させ、MAT1Aタンパク質の構造と機能に影響を与えている可能性が示唆された。
RESULTS: Three newborns were identified with MAT I/III deficiency by newborn screening, which yielded an incidence rate of 1 in 121 515. Amino acid and acylcarnitine analysis suggested that the serum methionine of the three patients have increased to various extents. All patients showed normal growth and development during follow-up, and were found to carry MAT1A gene variants including two missense variants [c.776C>T (p.Ala259Val) and c.791G>A (p.Arg264His)] and a synonymous variant [c.360C>T (p.Cys120Cys)]. Among these, c.776C>T (p.Ala259Val) and c.791G>A (p.Arg264His) were known to be pathogenic, whereas c.360C>T (p.Cys120Cys) was a novel variant. Bioinformatics analysis suggested that this variant may alter RNA splicing and affect the structure and function of the MAT1A protein.
結論:
MAT I/III 欠損症の新生児スクリーニングの系統的レビューが提供された。新規バリアントの発見は、MAT1A遺伝子のバリアントプロファイルを豊かにし、この疾患の診断の基礎を提供した。
CONCLUSION: A systematic review of newborn screening for MAT I/III deficiency was provided. Discovery of the novel variant has enriched the variant profile of the MAT1A gene and provided a basis for the diagnosis of this disease.