全ゲノムシークエンシングによる無症候性脳梗塞とKCNQ2, TCF4, RGS18多型との関連

Association between KCNQ2, TCF4 and RGS18 polymorphisms and silent brain infarction based on whole‑exome sequencing.

• Jung Oh Kim
• Kee Ook Lee
• Hyun Woo Kim
• Han Sung Park
• Jinkwon Kim
• Jung Hoon Sung
• Doyeun Oh
• Ok Joon Kim
• Nam Keun Kim

抄録

無症候性脳梗塞（SBI）とは、脳の画像処理によって確認される脳梗塞のことです。特に高齢者では、SBIが存在すると認知機能障害や機能障害、認知症のリスクが高まることが研究で明らかになっています。しかし、韓国人集団におけるSBIとこれらのリスクとの関連性についての研究はほとんど発表されていない。全ゲノムシークエンシングとPCR制限断片長多型（RFLP）解析を用いて，カリウム電圧チャネルサブファミリーQメンバー2（KCNQ2），転写因子4（TCF4），Gタンパク質シグナリング18（RGS18）遺伝子型とSBIとの関連を検討した．研究集団は、SBI患者407名（男性171名）と対照者401名（男性172名）であった。PCR RFLPを用いてジェノタイピングを行った。興味深いことに、TCF4 rs9957668T>C多型はSBI有病率と関連していた［TTvs.CC：調整オッズ比（AOR）、1.815、95％信頼区間（CI）、1.202-2.740；TT vs. TC+CC：調整オッズ比（AOR）、1.492、95％信頼区間（CI）、1.202-2.740；TT vs. TC+CC：調整オッズ比（AOR）、1.492、95％信頼区間（CI）、1.202-2.740；TT vs. TC+CC.AOR,1.492,95%CI,1.066-2.088;TT+TCvs.CC:AOR,1.454,95%CI,1.045-2.203]。KCNQ2 rs73146513A>GとTCF4 rs9957668T>C遺伝子型の組み合わせは、SBI有病率の増加と関連していた（AG/CC.AOR,3.719, 95%CI,1.766-7.833; AA/CC.AOR,3.201,95%CI,1.387-7.387）。)本研究では、TCF4 rs9957668T>C多型がSBIの危険因子である可能性が示された。したがって、TCF4 rs9957668T>C多型は、韓国人集団におけるSBIリスク上昇のバイオマーカーとして機能する可能性がある。

Silent brain infarction (SBI) is a cerebral infarction identified through brain imaging. In particular, studies have shown that the presence of SBI in elderly patients increases their risk of cognitive dysfunction, impairment and dementia. However, little research has been published on the relevance of SBI to these risks for the Korean population. The association between potassium voltage‑gated channel subfamily Q member 2 (KCNQ2), transcription factor 4 (TCF4) and regulator of G‑protein signaling 18 (RGS18) genotypes and SBI were investigated using whole‑exome sequencing and PCR restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. The study population included 407 patients with SBI (171 males) and 401 control subjects (172 males). Genotyping was performed using PCR RFLP. Interestingly, TCF4 rs9957668T>C polymorphisms were associated with SBI prevalence [TT vs. CC: adjusted odds ratio (AOR), 1.815, 95% confidence intervals (CI), 1.202‑2.740; TT vs. TC+CC: AOR, 1.492, 95% CI, 1.066‑2.088; TT+TC vs. CC: AOR, 1.454, 95% CI, 1.045‑2.203]. The combination of KCNQ2 rs73146513A>G and TCF4 rs9957668T>C genotypes was associated with increasing SBI prevalence (AG/CC: AOR, 3.719, 95% CI, 1.766‑7.833; AA/CC: AOR, 3.201, 95% CI, 1.387‑7.387). The present study showed that TCF4 rs9957668T>C polymorphisms may be risk factors for SBI. Therefore, the TCF4 rs9957668T>C polymorphism may serve as a biomarker for increased risk of SBI in the Korean population.