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ウイルス性HIV-1ウイルス検査におけるデュアルターゲットアプローチ。ウイルス学的モニタリングへの付加価値？
The dual-target approach in viral HIV-1 viremia testing: An added value to virological monitoring?
PMID: 32023284 PMCID: PMC7001951. DOI: 10.1371/journal.pone.0228192.
抄録
HIVウイルス負荷モニタリングにおいて、デュアルターゲット検出に基づく新しいHIV-1 RNA定量法の利用が増加しているが、デュアルターゲット検出の臨床的意味合いやHIV-1感染管理への影響は確立されていない。Aptima HIV-1 Quant Dx assayは、polとLTRを同時にターゲットとした次世代のHIVウイルス負荷測定法であり、polターゲットを中心とした定量結果が得られ、polシグナルがない場合はLTRターゲットを用いて結果を報告する。我々の研究室では、このプラットフォームを用いて1年間に行ったHIV-1ウイルス負荷試験のうち、約6％の結果がLTRシグナルによるものであった。興味深いことに、単一標的（polベース）アッセイに基づいて長期にわたりウイルス学的に抑制されていると考えられるART中の患者のごく一部（最大1％）にLTRベースのウイルス血症（時には1,000コピー/mLを超えることもある）が観察された。性別が男性であること、CD4細胞/mLが700以上対200未満であること、NRTIとNNRTI、PI/bまたはINSTIを含む二重療法を受けていることは、多変量ロジスティック回帰法によるLTRベースのHIV-1ウイルス負荷検出リスクの増加と独立して関連していた。LTR ベースの HIV-1 RNA レベルと PBMC-associated proviral DNA との間には、有意な線形相関が観察された。さらに、HIV-1 RNAレベルが200コピー/mLを超える少数の患者群では、縦断的な評価により、血漿中のウイルス感染とプロウイルスDNAの間に並行した動態が観察された。LTRベースのウイルス感染症患者における薬剤耐性評価のためのpol領域の塩基配列決定は、血漿HIV-1 RNAでは失敗したが、プロウイルスDNAでは成功した。LTRシグナルのみに基づくHIV-1ウイルス感染症の検出・定量は、従来の標的polでは検出できなかったが、デュアルターゲットアッセイを用いたHIV-1ウイルス感染症の検出・定量は、正確な評価が必要である。今回初めて報告されたこの現象の生物学的基盤を解明することは、病原性（LTR検出ウイルスの感染性、リザーバーのターンオーバー、免疫活性化など）と臨床の両面からの関連性と意味合いを確立するために必須である。
New methods of HIV-1 RNA quantification based on dual-target detection are increasingly used in HIV viral load monitoring, but clinical implications and impact of dual-target detection on HIV-1 infection management are not established. Aptima HIV-1 Quant Dx assay is a last generation HIV viral load method, that uses pol and LTR as simultaneous target, providing quantitative results based mainly on pol target, while LTR target is used to report the results when pol signal is absent. In our laboratory, about 6% of results of all HIV-1 viral load tests performed with this platform in one year period resulted from LTR signal. Interestingly, LTR-based viremia (sometimes exceeding 1,000 copies/mL) was observed in a small proportion (up to 1%) of patients under ART, considered for long time virologically suppressed on the basis of a single target (pol-based) assay. Male gender, >700 vs <200 CD4 cell/mL and dual therapy including NRTI plus either NNRTI, or PI/b or INSTI were independently associated with increased risk of LTR-based HIV-1 viral load detection by multivariable logistic regression. A significant linear correlation was observed between LTR-based HIV-1 RNA levels and PBMC-associated proviral DNA. Moreover, in a small group of patients with HIV-1 RNA levels >200 copies/mL, longitudinal assessments showed parallel kinetics between plasma viremia and proviral DNA. Sequencing of pol region for drug resistance assessment in patients with LTR-based viremia failed on plasma HIV-1 RNA, while it was successful on proviral DNA. The detection/quantification of HIV-1 viremia based only on LTR signal with a dual target assay in samples resulting undetectable with the more conventional target pol needs accurate evaluation; unravelling the biological basis of this phenomenon, here described for the first time, is mandatory to establish relevance and implication by both pathogenetic (i.e. infectivity of LTR-detected viruses, reservoir turnover, immune activation, etc.) and clinical standpoint.