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ヨルダンにおけるC型肝炎ウイルス遺伝子型分布の最新情報：アンマンの第三次医療教育病院からの12年間のレトロスペクティブ研究
An update on hepatitis C virus genotype distribution in Jordan: a 12-year retrospective study from a tertiary care teaching hospital in Amman.
PMID: 31892307 PMCID: PMC6938611. DOI: 10.1186/s12879-019-4735-3.
抄録
背景:
C 型肝炎ウイルス（HCV）の核酸ハイブリダイゼーション（NAH）は、ウイルス遺伝子型同定のための実用的で信頼性の高いツールである。遺伝子型の割り付けは、C 型慢性肝炎患者における治療の成功を予測する上で重要な因子である。本研究の目的は、2007 年から 2018 年の間にヨルダンで分離された HCV 臨床分離株間の遺伝子型分布を決定することであった。
BACKGROUND: Nucleic acid hybridization (NAH) of hepatitis C virus (HCV) is a practical and reliable tool for virus genotyping. Genotype assignment is an important factor in the prediction of treatment success in chronic hepatitis C patients. The aim of this study was to determine the genotype distribution among HCV clinical isolates in Jordan between 2007 and 2018.
方法:
ヨルダン大学病院（JUH）の2007年から2018年までの電子および紙ベースの臨床データ登録記録を、HCV遺伝子型、HCVウイルス負荷、アラニンアミノトランスフェラーゼ（ALT）検査結果を有する個体についてレトロスペクティブに調べた。遺伝子型の決定は、342人のユニークな個人から386リクエストが利用可能なHCV 5'非翻訳領域（5'UTR）を用いたNAH法に基づいて行った。
METHODS: Electronic and paper-based clinical data registry records from 2007 to 2018 at the Jordan University Hospital (JUH) were retrospectively examined for individuals with HCV genotype, HCV viral load, and alanine aminotransferase (ALT) testing results. Genotype determination was based on NAH technique using the HCV 5' untranslated region (5' UTR) with 386 requests available from 342 unique individuals.
結果:
342人のユニークな個人のうち、合計263人（76.9％）が最終解析に利用可能なジェノタイピング結果を持っており、259人がそれぞれ1つのジェノタイピング結果を持っていた。この研究で最も多かったHCV遺伝子型は、遺伝子型4（n=142、54.0％）、遺伝子型1（n=87、33.1％）、遺伝子型3（n=16、6.1％）、遺伝子型2（n=9、3.4％）、その他の未決定遺伝子型（n=5、1.9％）、および混合感染（n=4、1.5％）であった。サブジェノタイプ4c/d（n=13、28.3％）、サブジェノタイプ1a（n=11、23.9％）、サブジェノタイプ1b（n=10、21.7％）、サブジェノタイプ4a（n=8、17.4％）、サブジェノタイプ3a（n=2、4.3％）、サブジェノタイプ2a/cおよび4h（n=1、両方とも2.2％）の46人の個体について、サブジェノタイプの結果が得られた。ジェノタイプ1に感染した個体は、ジェノタイプ4に感染した個体と比較して高いウイルス負荷を示した（p=0.048、t検定）。若年のHCV感染者（52歳未満）は、高齢者に比べてALT値が高かった（p=0.036、t検定）。HCV獲得の自己申告による危険因子には、過去の手術歴、侵襲的歯科処置、輸血、自宅での分娩、自宅での割礼、湿潤カッピング療法（ヒジャマ）が含まれていた。
RESULTS: A total of 263 out of 342 unique individuals (76.9%) had genotyping results available for final analysis with 259 individuals each having a single genotyping result. The most common HCV genotypes in the study were: genotype 4 (n = 142, 54.0%), genotype 1 (n = 87, 33.1%), genotype 3 (n = 16, 6.1%), genotype 2 (n = 9, 3.4%), other undetermined genotypes (n = 5, 1.9%) and mixed infections (n = 4, 1.5%). Sub-genotyping results were available for 46 individuals as follows: sub-genotype 4c/d (n = 13, 28.3%), sub-genotype 1a (n = 11, 23.9%), sub-genotype 1b (n = 10, 21.7%), sub-genotype 4a (n = 8, 17.4%), sub-genotype 3a (n = 2, 4.3%), sub-genotypes 2a/c and 4 h (n = 1, 2.2% for both). Individuals infected with genotype 1 showed higher viral load when compared to those infected with genotype 4 (p = 0.048, t-test). Younger HCV-infected individuals (< 52 years) had higher ALT levels compared to older individuals (p = 0.036, t-test). Self-reported risk factors for HCV acquisition included: history of previous surgery, invasive dental procedures, and blood transfusion, delivery at home, circumcision at home and wet cupping therapy (hijama).
結論:
ヨルダンでは HCV の遺伝的多様性が高く、遺伝子型 4 と遺伝子型 1 が国内で最も有病率の高い遺伝子型であることが判明した。ウイルス遺伝子型が疾患マーカー（ウイルス負荷、ALT）に及ぼす潜在的な影響が検出され、さらなる評価が必要であった。本研究は、ヨルダンにおける HCV 感染の将来の予防と管理の計画に役立つ可能性がある。
CONCLUSIONS: High genetic diversity of HCV was found in Jordan, with genotypes 4 and 1 as the most prevalent genotypes co-circulating in the country. Potential impact of virus genotype on disease markers (viral load, ALT) was detected and needs further assessment. The study can be helpful to plan for future prevention and management of HCV infection in Jordan.