日本語AIでPubMedを検索
前浸潤性肺腺癌のゲノムおよび免疫プロファイリング
Genomic and immune profiling of pre-invasive lung adenocarcinoma.
PMID: 31784532 PMCID: PMC6884501. DOI: 10.1038/s41467-019-13460-3.
抄録
肺腺癌の前段階の形態として、原位置腺癌および低侵襲性腺癌がある。これらの病変のゲノムおよび免疫プロファイルは十分に理解されていない。ここでは、98例の肺腺癌前駆病変と99例の浸潤性腺癌のエクソームおよびトランスクリプトームシークエンスを報告する。浸潤前・低侵襲群では、EGFR、RBM10、BRAF、ERBB2、TP53、KRAS、MAP2K1、METが有意に変異した遺伝子として同定された。悪性腫瘍への進行中に頻度が増加するゲノム変化のクラスが明らかになった。これらには、TP53の変異、腕レベルのコピー数の変化、HLAのヘテロ接合性の喪失などが含まれる。免疫浸潤は染色体アーム6pのコピー数の変化と相関しており、アームレベルのイベントと腫瘍の免疫環境との関連を示唆している。
Adenocarcinoma in situ and minimally invasive adenocarcinoma are the pre-invasive forms of lung adenocarcinoma. The genomic and immune profiles of these lesions are poorly understood. Here we report exome and transcriptome sequencing of 98 lung adenocarcinoma precursor lesions and 99 invasive adenocarcinomas. We have identified EGFR, RBM10, BRAF, ERBB2, TP53, KRAS, MAP2K1 and MET as significantly mutated genes in the pre/minimally invasive group. Classes of genome alterations that increase in frequency during the progression to malignancy are revealed. These include mutations in TP53, arm-level copy number alterations, and HLA loss of heterozygosity. Immune infiltration is correlated with copy number alterations of chromosome arm 6p, suggesting a link between arm-level events and the tumor immune environment.