2015年中に採取された臨床検体からの新規全長変異株および欠失変異株ヒトMERS-CoVの単離と生育特性

Isolation and growth characterization of novel full length and deletion mutant human MERS-CoV strains from clinical specimens collected during 2015.

• Azaibi Tamin
• Krista Queen
• Clinton R Paden
• Xiaoyan Lu
• Erica Andres
• Senthilkumar K Sakthivel
• Yan Li
• Ying Tao
• Jing Zhang
• Shifaq Kamili
• Abdullah M Assiri
• Ali Alshareef
• Taghreed A Alaifan
• Asmaa M Altamimi
• Hani Jokhdar
• John T Watson
• Susan I Gerber
• Suxiang Tong
• Natalie J Thornburg

抄録

中東呼吸器症候群（MERS）は、ヒトコロナウイルス（CoV）である MERS-CoV によって引き起こされるウイルス性呼吸器疾患で、2012 年 9 月にサウジアラビアで初めて報告されました。フルゲノムシークエンシングと系統解析を用いて、科学者たちは、ヒトと人獣共通感染性の宿主であるドロメダリーラクダにおける MERS-CoV の 3 つのクラードと複数の系統を同定してきました。本研究では、2015年にサウジアラビアの患者から採取した8つのMERS-CoV分離株を特徴付けた。これらのウイルス単離株についてフルゲノムシークエンシングを行い、対応する臨床検体と比較した。分離株はすべてクラッド B、系統 4 および 5 であった。分離株のうち3株は、ゲノムの5'UTR、ORF1a、ORF3の3つの独立した領域に位置する欠失を有していた。すべての新規MERS-CoV株は、Vero細胞およびHuh7細胞で効率的に複製された。5'UTRとORF1aに欠失を持つウイルスは、Vero細胞ではウイルスの放出に障害があった。これらのデータは、ヒト感染時のMERS-CoVゲノムの可塑性を強調している。

Middle East respiratory syndrome (MERS) is a viral respiratory illness first reported in Saudi Arabia in September 2012 caused by the human coronavirus (CoV), MERS-CoV. Using full-genome sequencing and phylogenetic analysis, scientists have identified three clades and multiple lineages of MERS-CoV in humans and the zoonotic host, dromedary camels. In this study, we have characterized eight MERS-CoV isolates collected from patients in Saudi Arabia in 2015. We have performed full-genome sequencing on the viral isolates, and compared them to the corresponding clinical specimens. All isolates were clade B, lineages 4 and 5. Three of the isolates carry deletions located on three independent regions of the genome in the 5'UTR, ORF1a and ORF3. All novel MERS-CoV strains replicated efficiently in Vero and Huh7 cells. Viruses with deletions in the 5'UTR and ORF1a exhibited impaired viral release in Vero cells. These data emphasize the plasticity of the MERS-CoV genome during human infection.