RST1とRIPRはシロイヌナズナの細胞質RNAエクソソームとスキー複合体に接続している

RST1 and RIPR connect the cytosolic RNA exosome to the Ski complex in Arabidopsis.

• Heike Lange
• Simon Y A Ndecky
• Carlos Gomez-Diaz
• David Pflieger
• Nicolas Butel
• Julie Zumsteg
• Lauriane Kuhn
• Christina Piermaria
• Johana Chicher
• Michael Christie
• Ezgi S Karaaslan
• Patricia L M Lang
• Detlef Weigel
• Hervé Vaucheret
• Philippe Hammann
• Dominique Gagliardi

抄録

RNAエキソソームは、進化的に保存された構造と機能を持つ重要な3'-5'エキソリボヌクレアーゼである。その細胞質機能はSKI7とSKI複合体を必要とします。ここでは、ARM-repeat protein RESURRECTION1 (RST1)とRST1 INTERACTING PROTEIN (RIPR)が、シロイヌナズナの細胞質RNAエクソソームとスキー複合体を接続していることを、共精製実験により明らかにした。rst1およびripr変異体で観察された小RNA集団は、RRP45B/CER7コアエキソソームサブユニットを欠いた変異体でも検出される。このように、分子的・遺伝的証拠は、RST1、RIPR、RNAエキソソームの間の物理的・機能的なつながりを支持している。このように、RST1、RIPR、RNAエキソソームとの物理的・機能的な関連性は、RST1、RIPR、RNAエキソソームとの物理的・機能的な関連性を裏付けるものであると考えられる。RST1は植物に限らず、ヒトを含む動物にも同様のドメイン構造を持つ同族体が存在するが、機能は不明である。

The RNA exosome is a key 3'-5' exoribonuclease with an evolutionarily conserved structure and function. Its cytosolic functions require the co-factors SKI7 and the Ski complex. Here we demonstrate by co-purification experiments that the ARM-repeat protein RESURRECTION1 (RST1) and RST1 INTERACTING PROTEIN (RIPR) connect the cytosolic Arabidopsis RNA exosome to the Ski complex. rst1 and ripr mutants accumulate RNA quality control siRNAs (rqc-siRNAs) produced by the post-transcriptional gene silencing (PTGS) machinery when mRNA degradation is compromised. The small RNA populations observed in rst1 and ripr mutants are also detected in mutants lacking the RRP45B/CER7 core exosome subunit. Thus, molecular and genetic evidence supports a physical and functional link between RST1, RIPR and the RNA exosome. Our data reveal the existence of additional cytosolic exosome co-factors besides the known Ski subunits. RST1 is not restricted to plants, as homologues with a similar domain architecture but unknown function exist in animals, including humans.