バクテリアの翻訳開始に伴うIF3とtRNAの大規模移動

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Cell.2016 Sep;167(1):133-144.e13. S0092-8674(16)31172-2. doi: 10.1016/j.cell.2016.08.074.

バクテリアの翻訳開始に伴うIF3とtRNAの大規模移動

Large-Scale Movements of IF3 and tRNA during Bacterial Translation Initiation.

Tanweer Hussain
Jose L Llácer
Brian T Wimberly
Jeffrey S Kieft
V Ramakrishnan

PMID: 27662086 PMCID: PMC5037330. DOI: 10.1016/j.cell.2016.08.074.

抄録

細菌の翻訳開始においては、3つの開始因子（IFs 1-3）が、開始因子tRNAと30SリボソームサブユニットのP部位の開始コドンを選択することを可能にしている。ここでは、細菌の30Sサブユニットと開始因子tRNA、mRNA、IF1-3との複合体の11の単一粒子低温電子顕微鏡（cryoEM）による再構成を報告する。IF1は、IF2とIF3に重要なアンカーポイントを提供し、それによってそれらの活性を高める。IF2は、tRNA上で荷電したフォルミルメチオニル部位を捕捉するのに適した拡張コンフォメーションにドメインを配置します。IF3とtRNAは、フォルミルメチオニルtRNA(fMet-tRNA(fMet))の開始コドン認識のためのPサイトへの収容を容易にするために、大きな構造変化を受けます。

In bacterial translational initiation, three initiation factors (IFs 1-3) enable the selection of initiator tRNA and the start codon in the P site of the 30S ribosomal subunit. Here, we report 11 single-particle cryo-electron microscopy (cryoEM) reconstructions of the complex of bacterial 30S subunit with initiator tRNA, mRNA, and IFs 1-3, representing different steps along the initiation pathway. IF1 provides key anchoring points for IF2 and IF3, thereby enhancing their activities. IF2 positions a domain in an extended conformation appropriate for capturing the formylmethionyl moiety charged on tRNA. IF3 and tRNA undergo large conformational changes to facilitate the accommodation of the formylmethionyl-tRNA (fMet-tRNA(fMet)) into the P site for start codon recognition.