アーモンドに感染する新規ルテウイルス「アーモンドルテウイルス1」の完全ゲノム配列

Complete genome sequence of almond luteovirus 1, a novel luteovirus infecting almond.

• Maryam Khalili
• Thierry Candresse
• Chantal Faure
• Armelle Marais

抄録

本研究では、アーモンドから検出された新規ルテウイルスの全ゲノム配列を、ハイスループットシーケンシングを用いて報告する。この新しいルテウイルスのゲノムは5,047ヌクレオチドから構成されており、そのゲノム構造は最近報告されたネクタリン茎孔食関連ウイルス（NSPaV）と類似しており、複製関連タンパク質、コートタンパク質（CP）、ルテウイルスのアブラムシ感染に関与するCPリードスルータンパク質をコードする4つのオープンリーディングフレームのみが存在する。このウイルスは、最も近縁のルテウイルスであるNSPaVと、P1-P2融合タンパク質のアミノ酸同一性が79％、P3-P5タンパク質のアミノ酸同一性が57.8％であることから、新種であることが示唆され、「アーモンド関連ルテウイルス1」という名称が提案されている。アーモンドに感染するルテオウイルスの報告はこれが初めてである。

In this study, we report the complete genome sequence of a novel luteovirus detected in almond using high-throughput sequencing. The genome of the new luteovirus comprises 5,047 nucleotides, and its genomic organization is similar to that of the recently described nectarine stem pitting associated virus (NSPaV), with only four open reading frames, encoding replication-related proteins, the coat protein (CP), and a CP readthrough protein involved in the aphid transmission of luteovirids. Phylogenic and pairwise distance analyses showed that this virus shares 79% and 57.8% amino acid identity in the P1-P2 fusion protein and the P3-P5 protein, respectively, with the most closely related luteovirus, NSPaV, suggesting that it represents a novel species, for which the name "Almond associated luteovirus 1" is proposed. To our knowledge, this is the first report of an almond-infecting luteovirus.