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髭竜アデノウイルス1の完全なゲノム配列には、C型レクチン様ドメインスーパーファミリーのタンパク質をコードする3つの遺伝子が含まれています
The complete genome sequence of bearded dragon adenovirus 1 harbors three genes encoding proteins of the C-type lectin-like domain superfamily.
PMID: 32302697 DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104321.
抄録
アガミドアデノウイルス１としても知られるヒゲ竜アデノウイルス１（ＢＤＡｄＶ-１）は、最も一般的な扁平板状の外来ペット爬虫類である内陸のヒゲ竜（Ｐｏｇｏｎａ ｖｉｔｔｉｃｅｐｓ）の流行性感染症として世界的に報告されている。アデノウイルスDNAポリメラーゼとヘキソン遺伝子の限られた配列データから、BDAdV-1はアタデノウイルス属アデノウイルス科に属することが示唆されている。アタデノウイルスは反芻動物，有袋類，爬虫類，鳥類に感染するが，この属は扁平爬虫類由来であることが示されている。本研究では、BDAdV-1の全ゲノム配列をスクリーニング調査し、その結果を報告する。BDAdV-1のゲノムは35,276bpで、32の仮説遺伝子が含まれています。BDAdV-1のゲノム構造はアタデノウイルス属に特徴的なものであるが、発散しているLH3遺伝子が蛇アデノウイルス1のような他の属に比べて構造的な相互作用が異なることを示している。我々は5つの新規オープンリーディングフレーム（ORF）を同定したが、そのうち3つはC型レクチン様ドメイン（CTLD）スーパーファミリーのタンパク質をコードしていた。ORF3は、ナチュラルキラー細胞表面受容体と構造的に類似したCTLDグループII様ドメイン構造を有しており、また、ニューロトロピズムのためのアルファヘルペスウイルスウイルスウイルスウイルス性因子遺伝子UL45と構造的に類似していた。ORF4と6は、典型的なアデノウイルス右末端遺伝子と比較して非常に長く、これまでに知られていなかった新規なドメイン構造を持つCTLDスーパーファミリーのメンバーをコードしている可能性があります。BDAdV-1は、これまでアデノウイルス属の中で最も多様性のあるメンバーであり、アデノウイルスの多様性、進化、病因についての新たな知見を提供している。
Bearded dragon adenovirus 1 (BDAdV-1), also known as agamid adenovirus 1, has been described worldwide as a prevalent infectious agent of the inland bearded dragon (Pogona vitticeps), the most common squamate exotic pet reptile. Previous limited sequence data of the adenoviral DNA polymerase and hexon genes indicated that BDAdV-1 is a member of genus Atadenovirus family Adenoviridae. Atadenoviruses infect ruminants, marsupials, testudine reptiles and birds, yet the genus has been shown to be of squamate reptile origin. Here, we report a screening survey along with the complete genome sequence of BDAdV-1, derived directly from the sample of a deceased juvenile dragon showing central nervous system signs prior to passing. The BDAdV-1 genome is 35,276 bp and contains 32 putative genes. Its genome organization is characteristic of the members of genus Atadenovirus, however, a divergent LH3 gene indicates structural interactions of different nature compared to other genus members such as snake adenovirus 1. We identified five novel open reading frames (ORFs), three of which encode proteins of the C-type lectin-like domain (CTLD) superfamily. ORF3 has a CTLD group II-like domain architecture displaying structural similarity with natural killer cell surface receptors and with an alphaherpesviral virulence factor gene for neurotropism, UL45. ORF4 and 6 are extremely long compared to typical adenoviral right-end genes and possibly encode members of the CTLD superfamily with novel, previously undescribed domain architectures. BDAdV-1 is the hitherto most divergent member of genus Atadenovirus providing new insights on adenoviral diversity, evolution and pathogenesis.
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